MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 3849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015686	AATATA	2	12	50	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735033
2	NC_015686	TTA	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735033
3	NC_015686	GGATA	2	10	86	95	40 %	20 %	40 %	0 %	337735033
4	NC_015686	A	6	6	126	131	100 %	0 %	0 %	0 %	337735033
5	NC_015686	ATT	3	9	136	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735033
6	NC_015686	AGA	3	9	148	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735033
7	NC_015686	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735033
8	NC_015686	A	6	6	174	179	100 %	0 %	0 %	0 %	337735033
9	NC_015686	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	337735033
10	NC_015686	ATG	2	6	263	268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735033
11	NC_015686	AAT	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735033
12	NC_015686	GCTTA	2	10	366	375	20 %	40 %	20 %	20 %	337735033
13	NC_015686	ATC	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735033
14	NC_015686	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735033
15	NC_015686	AGG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735033
16	NC_015686	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	337735033
17	NC_015686	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	337735033
18	NC_015686	CAG	2	6	596	601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735033
19	NC_015686	CA	3	6	676	681	50 %	0 %	0 %	50 %	337735033
20	NC_015686	AATTA	2	10	705	714	60 %	40 %	0 %	0 %	337735033
21	NC_015686	TAGA	2	8	743	750	50 %	25 %	25 %	0 %	337735033
22	NC_015686	GAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735034
23	NC_015686	TAT	2	6	1408	1413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
24	NC_015686	GTA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
25	NC_015686	TAA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
26	NC_015686	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735034
27	NC_015686	ATG	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
28	NC_015686	ATG	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
29	NC_015686	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	337735034
30	NC_015686	AGTAT	2	10	1986	1995	40 %	40 %	20 %	0 %	337735034
31	NC_015686	GCA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735034
32	NC_015686	AGT	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
33	NC_015686	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	337735034
34	NC_015686	TAGTT	2	10	2576	2585	20 %	60 %	20 %	0 %	337735034
35	NC_015686	CAA	2	6	2587	2592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735034
36	NC_015686	CTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735034
37	NC_015686	CTT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735034
38	NC_015686	GAT	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
39	NC_015686	CTG	2	6	2698	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735034
40	NC_015686	GGA	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735034
41	NC_015686	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
42	NC_015686	TAG	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
43	NC_015686	TAA	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
44	NC_015686	ATA	2	6	2820	2825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
45	NC_015686	TA	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
46	NC_015686	AT	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
47	NC_015686	CATA	2	8	2910	2917	50 %	25 %	0 %	25 %	337735034
48	NC_015686	AGA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735034
49	NC_015686	TTAGA	2	10	3076	3085	40 %	40 %	20 %	0 %	337735034
50	NC_015686	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
51	NC_015686	TAC	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735034
52	NC_015686	GAT	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
53	NC_015686	TA	3	6	3128	3133	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
54	NC_015686	TGA	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
55	NC_015686	AAAT	2	8	3143	3150	75 %	25 %	0 %	0 %	337735034
56	NC_015686	TAA	2	6	3212	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
57	NC_015686	ATA	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
58	NC_015686	GAT	2	6	3285	3290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
59	NC_015686	ATG	3	9	3376	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
60	NC_015686	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
61	NC_015686	AT	3	6	3414	3419	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
62	NC_015686	TA	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
63	NC_015686	AT	3	6	3438	3443	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
64	NC_015686	AAAGT	2	10	3463	3472	60 %	20 %	20 %	0 %	337735034
65	NC_015686	TA	5	10	3501	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
66	NC_015686	TAT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
67	NC_015686	ATA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
68	NC_015686	ATA	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
69	NC_015686	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
70	NC_015686	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
71	NC_015686	TAT	2	6	3648	3653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735034
72	NC_015686	AATT	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
73	NC_015686	TA	4	8	3756	3763	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
74	NC_015686	TAA	2	6	3776	3781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
75	NC_015686	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735034
76	NC_015686	AT	4	8	3852	3859	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
77	NC_015686	TA	4	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	337735034
78	NC_015686	ATG	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735034
79	NC_015686	GAA	3	9	4109	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735035
80	NC_015686	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735035
81	NC_015686	GGC	2	6	4167	4172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337735035
82	NC_015686	TAAA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	337735035
83	NC_015686	GACA	2	8	4651	4658	50 %	0 %	25 %	25 %	337735035
84	NC_015686	CTA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735035
85	NC_015686	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735035
86	NC_015686	AAT	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
87	NC_015686	ACA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735035
88	NC_015686	CAG	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735035
89	NC_015686	TACA	2	8	5003	5010	50 %	25 %	0 %	25 %	337735035
90	NC_015686	AAG	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735035
91	NC_015686	TAAA	2	8	5281	5288	75 %	25 %	0 %	0 %	337735035
92	NC_015686	CTA	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735035
93	NC_015686	CTT	2	6	5377	5382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735035
94	NC_015686	TGG	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735035
95	NC_015686	CAA	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735035
96	NC_015686	TTG	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735035
97	NC_015686	TA	3	6	5616	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
98	NC_015686	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
99	NC_015686	TA	3	6	5678	5683	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
100	NC_015686	GAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
101	NC_015686	TAG	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
102	NC_015686	ATA	2	6	5781	5786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
103	NC_015686	CATG	2	8	5805	5812	25 %	25 %	25 %	25 %	337735035
104	NC_015686	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
105	NC_015686	TAC	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735035
106	NC_015686	GAT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
107	NC_015686	GATAAA	2	12	5958	5969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337735035
108	NC_015686	ATG	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
109	NC_015686	ATTA	2	8	6129	6136	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
110	NC_015686	TTC	2	6	6167	6172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735035
111	NC_015686	AT	3	6	6174	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
112	NC_015686	TAC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735035
113	NC_015686	AGTT	2	8	6295	6302	25 %	50 %	25 %	0 %	337735035
114	NC_015686	TAAAAA	2	12	6317	6328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337735035
115	NC_015686	CAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735035
116	NC_015686	AAT	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
117	NC_015686	TAT	2	6	6381	6386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735035
118	NC_015686	ATG	3	9	6394	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735035
119	NC_015686	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735035
120	NC_015686	ATT	2	6	6487	6492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735035
121	NC_015686	AAT	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
122	NC_015686	TGG	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735035
123	NC_015686	ATA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
124	NC_015686	AT	3	6	6586	6591	50 %	50 %	0 %	0 %	337735035
125	NC_015686	CTA	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735035
126	NC_015686	TAA	2	6	6620	6625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
127	NC_015686	TAA	2	6	6661	6666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735035
128	NC_015686	AAATTG	2	12	6981	6992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337735036
129	NC_015686	ATT	2	6	7017	7022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735036
130	NC_015686	ATA	2	6	7026	7031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735036
131	NC_015686	A	7	7	7053	7059	100 %	0 %	0 %	0 %	337735036
132	NC_015686	TAC	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735036
133	NC_015686	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735036
134	NC_015686	GAA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735036
135	NC_015686	CGA	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735036
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399	NC_015686	TCTA	2	8	19911	19918	25 %	50 %	0 %	25 %	337735050
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